2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one (CAS 1339892-66-8) — une brique de construction spirocyclique oxygénée au service de la découverte de médicaments
CAS 1339892-66-8 | La 2-oxaspiro[3.3]heptan-6-one est une brique de construction spirocyclique oxygénée combinant un oxétane et une cyclobutanone, utilisée dans les brevets TYK2, EBP, RIP1, HDAC6 et KAT6.
1. Informations produit
Le 2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one est une brique de construction (building block) spirocyclique de faible poids moléculaire, combinant un noyau oxétane et une cyclobutanone partageant un atome de carbone commun. Sa géométrie 3D et son encombrement stérique en font un intermédiaire prisé pour l'exploration des relations structure-activité (SAR) en chimie médicinale.
| Paramètre | Valeur |
|---|---|
| Nom | 2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one |
| N° CAS | 1339892-66-8 |
| N° CE | 840-774-4 |
| Formule moléculaire | C₆H₈O₂ |
| Masse moléculaire | 112,13 g/mol |
| Aspect physique | Liquide incolore à jaune pâle |
| SMILES | O=C1CC2(COC2)C1 |
| InChIKey | JWNCVDJOXJTJPB-UHFFFAOYSA-N |
| Accepteurs de liaisons H (HBA) | 2 |
| Donneurs de liaisons H (HBD) | 0 |
| Liaisons rotatives | 0 |
| Surface polaire topologique (TPSA) | 26,3 Ų |
| XLogP3-AA | −0,6 |
Sa faible masse, son TPSA modeste et l'absence de liaisons rotatives placent cette molécule dans un espace physico-chimique particulièrement favorable au respect des règles de Lipinski et de Veber — un atout pour les campagnes d'optimisation menées sur les composés chefs de file (lead compounds).
2. Pourquoi les structures spiro oxygénées ?
Les motifs spirocycliques oxygénés connaissent un essor remarquable en chimie médicinale moderne. Trois arguments fondamentaux expliquent cet engouement :
(a) Sortir du plan pour gagner en tridimensionnalité
Les échafaudages aromatiques plats dominent historiquement les bibliothèques de chimie, mais leur manque de caractère 3D se traduit souvent par une faible solubilité, une métabolisation rapide et une sélectivité limitée face aux nouvelles cibles. L'introduction d'un squelette spiro décalé la molécule de la « zone plate » typique des composés aromatiques, augmentant la fraction d'atomes sp³ (Fsp³) et améliorant les propriétés développables (developability).
(b) Rigidité et polarité combinées
La rigidité conformationnelle d'un cœur spiro réduit l'entropie de liaison, ce qui se traduit par un gain d'affinité pour la cible. L'oxygène de l'oxétane, quant à lui, agit comme accepteur de liaison hydrogène modéré, ce qui :
- augmente la polarité locale sans grever excessivement la lipophilie ;
- améliore souvent la solubilité aqueuse ;
- peut établir des interactions spécifiques avec les résidus polaires du site actif ;
- se révèle métaboliquement plus stable que de simples éthers acycliques.
(c) Le carbonyle comme porte d'entrée vers la dérivatisation
La fonction cyclobutanone portée par le squelette est un point d'ancrage synthétique extrêmement polyvalent. Elle permet d'accéder rapidement à une grande diversité de produits dérivés via des transformations bien établies :
- Amination réductive : accède à des amines tertiaires spirocycliques, des motifs ubiquitaires en pharmacologie ;
- Additions d'organolithiens et de réactifs de Grignard : génèrent des alcools tertiaires encombrés, utiles comme points de diversification ;
- Réactifs alkynylmétal : introduisent des fonctions alcynyl, propargyliques ou des précurseurs de chimie « click » ;
- Réduction en alcool : fournit un alcool secondaire,handlesi précieux pour la suite de la SAR.
Cette accessibilité synthétique est ce qui transforme un échafaudage original en une véritable plateforme de découverte, plutôt qu'en une simple molécule de curiosité.
3. Applications dans les brevets
Le 2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one a déjà trouvé sa place dans plusieurs familles de brevets pharmaceutiques récents, où il intervient comme fragment central ou bioisostère d'autres groupes fonctionnels :
- Inhibiteurs de TYK2 — intégré par amination réductive du carbonyle ; rendements atteignant 67,4 % pour l'étape de fonctionnalisation, ce qui en fait une transformation reproductible à l'échelle du laboratoire.
- Inhibiteurs de l'EBP (emopamil-binding protein) — incorporé avec des rendements de l'ordre de 32 à 43 %, dans le contexte de la modulation du métabolisme du cholestérol.
- Inhibiteurs d'HDAC6 — employé en combinaison avec un motif 1,3,4-oxadiazole et une pipéridine pour la conception d'inhibiteurs de désacétylases sélectifs.
- Inhibiteurs de RIP1 kinase — installé via une addition de TMS-acétylènelithium, générant un intermédiaire alcynyl propice à une cyclisation ultérieure.
- Inhibiteurs de KAT6 — monté par addition d'aryllithium, avec des rendements atteignant 72 %, pour la conception d'inhibiteurs de lysine acétyltransférases.
Cette diversité de cibles — kinases, enzymes métaboliques, épigénétiques — illustre la polyvalence de l'échafaudage comme point de départ pour des programmes thérapeutiques très différents.
4. Directions de R&D actuelles
Plusieurs axes de recherche témoignent du potentiel encore largement inexploité de cette brique de construction :
- Modulation des kinases — TYK2 et plus largement la famille JAK, dans les pathologies inflammatoires et auto-immunes ;
- Cibles métaboliques — EBP, SGLT (cotransporteurs sodium-glucose) pour le diabète et l'obésité ;
- Régulation épigénétique — HDAC6 et KAT6 dans les hémopathies et certains cancers solides ;
- Nécroptose et inflammation — RIP1 kinase comme cible émergente dans les maladies neurodégénératives et inflammatoires ;
- Métabolisme du tryptophane — TDO2 (tryptophane 2,3-dioxygénase) en immuno-oncologie ;
- Conception de bibliothèques spiro oxygénées — diversification systématique autour de l'échafaudage pour explorer un espace chimique tridimensionnel et augmenter le Fsp³ des collections.
Le 2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one sert également de bioisostère à des fragments pipéridiniques, piperaziniques ou cyclohexanoniques, en particulier lorsque l'on cherche à augmenter la polarité sans alourdir la masse moléculaire.
Avertissement : les informations présentées dans cette section reflètent l'état de la littérature scientifique et brevet disponible. Elles ne constituent ni une recommandation thérapeutique, ni une garantie d'efficacité ou d'innocuité, et ne doivent pas être interprétées comme un conseil médical ou pharmaceutique. Toute utilisation doit s'inscrire dans un cadre de recherche réglementé.
5. Série des dérivés
L'équipe de Burke et coll., dans une publication marquante du Journal of the American Chemical Society (JACS, 2021), a démontré l'accessibilité synthétique d'une famille cohérente de dérivés à partir de cette même brique de construction :
- Dérivés alcool — obtenus par réduction contrôlée du carbonyle ;
- Dérivés amine — via amination réductive en présence d'amines primaires ou secondaires ;
- Dérivés aryle — par addition d'aryllithiens ou de réactifs organomagnésiens ;
- Dérivés alkynyle — par addition de lithio-acétylènes protégés, suivie éventuellement de fonctionnalisation.
Cette série illustre la convivialité synthétique de l'échafaudage et fournit aux équipes de R&D un point de départ directement exploitable pour des campagnes de SAR rapide.
6. Marché et besoins clients
La demande pour le 2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one émane principalement d'équipes de chimie médicinale travaillant à l'échelle du gramme au kilogramme dans le cadre de programmes de découverte précoce. Les attentes des clients se structurent autour de plusieurs axes :
- Échelle adaptée au phasage projet — disponibilité en quantités compatibles avec les étapes de hit-to-lead puis de lead optimization ;
- Cohérence inter-lots — reproductibilité du profil de pureté entre les campagnes pour soutenir des SAR fiables ;
- Maîtrise des impuretés — caractérisation précise et tenue de spécifications stables ;
- Documentation analytique complète — HPLC, RMN ¹H et ¹³C, HRMS, GC si pertinent, et certificat d'analyse (CoA) systématique ;
- Conditionnement adapté — flacons ambrés, atmosphère inerte, étiquetage conforme ;
- Délai de livraison prévisible — chaîne logistique maîtrisée, en particulier pour les références sensibles ou à rotation rapide.
Shenglan Chemical répond à ces exigences par une organisation industrielle structurée, capable d'accompagner aussi bien les commandes de recherche que les montées en échelle intermédiaires.
7. Qualité et sécurité
Le 2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one se présente sous la forme d'un liquide inflammable. Sa classification et son maniement doivent respecter les mentions de danger suivantes :
- H227 — Liquide combustible.
- H315 — Provoque une irritation cutanée.
- H318 — Provoque de graves lésions des yeux.
- H335 — Peut irriter les voies respiratoires.
Stockage et manipulation
- Stocker dans un endroit frais, bien ventilé, à l'écart des sources d'ignition et des oxydants forts ;
- Conserver sous atmosphère inerte (azote ou argon) pour limiter l'oxydation et la dégradation à long terme ;
- Travailler sous hotte ventilée, en particulier pour les opérations de pesée et de transfert ;
- Maintenir le contenant hermétiquement fermé après usage.
Équipements de protection individuelle (EPI)
- Gants résistants aux solvants organiques (par exemple nitrile ou butyle) ;
- Lunettes de sécurité à coques latérales, ou écran facial pour les opérations à risque ;
- Blouse de laboratoire en coton ignifugé ;
- Protection respiratoire adaptée si la ventilation locale est insuffisante.
Sécurité procédé et montée en échelle
Pour les étapes de scale-up, une analyse de sécurité procédé doit être conduite : étude calorimétrique (DSC, RC1), évaluation des risques d'accumulation, gestion des effluents et des solvants résiduels. Les opérations à grande échelle doivent être réalisées par un personnel formé, dans des installations adaptées et conformes à la réglementation en vigueur.
Ce composé est destiné à un usage industriel et de recherche. Il n'est pas destiné à un usage humain, vétérinaire ou diagnostique in vivo.
8. À propos de Shenglan Chemical
Le 2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one (référence catalogue SL1112012) est fabriqué et commercialisé par Shandong Shenglan Chemical Technology Co., Ltd. L'entreprise propose ce composé avec une pureté garantie ≥ 97 % (HPLC), accompagnée d'un certificat d'analyse complet et d'une traçabilité lot à lot.
Forte d'une expertise dans la chimie fine et la synthèse de briques de construction à forte valeur ajoutée pour la pharmacie, Shenglan Chemical met l'accent sur la reproductibilité de la qualité, la réactivité logistique et le support technique aux équipes de R&D de ses clients.
Conclusion
La valeur du 2-Oxaspiro[3.3]heptan-6-one ne réside pas dans sa simple nouveauté structurelle. Elle s'enracine dans une combinaison rare de propriétés :
- une tridimensionnalité qui élargit l'espace chimique exploré ;
- une rigidité conformationnelle favorable à l'affinité pour la cible ;
- une polarité bien dosée, qui se traduit par de bonnes propriétés développables ;
- et surtout, une dérivatisation rapide et polyvalente à partir du carbonyle, qui en fait une véritable plateforme pour la chimie médicinale.
Ces atouts en font un partenaire de choix pour les programmes de découverte de médicaments modernes, où la quête d'originalité structurelle ne peut plus être dissociée des contraintes de développabilité et d'accessibilité synthétique.